ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ ΘΕΩΡΙΑ
ΠΑΝΑΓΙΩΤΗΣ ΖΟΥΜΠΟΥΛΑΚΗΣ
Το μάθημα χωρίζεται σε δύο μέρη (Α) τη δομική βιοχημεία και (Β) τον μεταβολισμό.
Το πρώτο μέρος περιλαμβάνει τη δομή και οργάνωση των βιομορίων με έμφαση τις πρωτείνες. Το δεύτερο μέρος εστιάζει στις κυριότερες μεταβολικές πορείες, τη ρύθμιση και έλεγχό τους καθώς και την αλληλεξάρτηση και συνδυασμό τους.
Το εργαστηριακό μέρος του μαθήματος περιλαμβάνει βασικές εργαστηριακές τεχνικές απομόνωσης, διαχωρισμού και προσδιορισμού βιομορίων που βρίσκουν εφαρμογή και στο χώρο των τροφίμων.
Αναλυτικότερα:
Θεωρητικό Μέρος Μαθήματος
Α ΜΕΡΟΣ: ΔΟΜΙΚΗ ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ
Εισαγωγή, βασικά χαρακτηριστικά των βιομορίων. Αμινοξέα, Πρωτεΐνες (δομές, ιδιότητες), Ένζυμα (κατάταξη, κινητική και παράμετροι που επιδρούν, ρύθμιση, εξήγηση της καταλυτικής τους δράσης, ισοένζυμα). Χρήση ελεύθερων υπολογιστικών εργαλείων για τη μελέτη της τριτοταγούς/τεταρτοταγούς δομής πρωτεινών, ενεργών κέντρων ενζύμων και άλλων δομικών στοιχείων.
Απομόνωση, παραλαβή πρωτεινών και και προσδιορισμός της δομής τους.
Πολυσακχαρίτες (κύριες κατηγορίες, βιοσυνθετικές οδοί και βιοδραστικότητα, παραδείγματα)
Λιπίδια (κύριες κατηγορίες, βιοσυνθετικές οδοί και βιοδραστικότητα, παραδείγματα)
Β ΜΕΡΟΣ: ΜΕΤΑΒΟΛΙΣΜΟΣ
Βασικές αρχές του μεταβολισμού, σύνδεση αναβολισμού και καταβολισμού.
Γλυκόλυση
Γλυκονεογένεση
Κύκλος κιτρικού οξέος
Οξειδωτική φωσφορυλίωση
Οδός φωσφορικών πεντοζών
Καταβολισμός των Λιπαρών Οξέων
Οξείδωση Αμινοξέων και Παραγωγή Ουρίας
Φωτοσύνθεση
Βιοσύνθεση λιπιδίων
Βιοσύνθεση αμινοξέων
Μεταβολική/Ορμονική ρύθμιση
Εργαστηριακό Μέρος Μαθήματος
Στο εργαστήριο πραγματοποιούνται δύο ενότητες ασκήσεων ;
1. Μελέτη των παραγόντων που επηρεάζουν την δράση των ενζύμων με εφαρμογή στο σύστημα του ενζύμου της υπεροξειδάσης (από ραπανάκι) . Αναλυτικά μελετώνται :
Η επίδραση της ποσότητας του ενζύμου
Η επίδραση του pH και της θερμοκρασίας
Η επίδραση του υποστρώματος και του αναστολέα
Εύρεση μηχανισμού αντίδρασης και είδους αναστολής
2. Βασικές τεχνικές διαχωρισμού και απομόνωσης βιομορίων:
Απομόνωση λιπιδίων κατά Bligh-Dyer
TLC αμινοξέων και λιπιδίων
Απομόνωση DNA από φυτικό ιστό
PCR (Polymerase Chain Reaction) Αλυσιδωτή Αντίδραση Πολυμεράσης
Ηλεκτροφορητικός διαχωρισμός τμημάτων DNA
ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ
- Βιβλίο [102074412]: ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ, Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Gregory J. Gatto, Jr., Lubert Stryer, ISBN: 9789605246365, ΙΔΡΥΜΑ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ & ΕΡΕΥΝΑΣ-ΠΑΝΕΠΙΣΤΗΜΙΑΚΕΣ ΕΚΔΟΣΕΙΣΚΡΗΤΗΣ
- Βιβλίο [77107011]: Lehninger's Βασικές Αρχές Βιοχημείας 2η έκδοση, Nelson David L., Cox Michael M., ISBN: 9789925563203, BROKEN HILL PUBLISHERS LTD
- Βιβλίο[122075476]: Βιοχημεία Έκδοση: 1η έκδ./2023, Συγγραφείς: Appling Dean R., Anthony-Cahill Spencer J., Mathews Christopher K. (Συγγρ.) - Καπόλος Ιωάννης, ΖουμπουλάκηςΠαναγιώτης, Μπράλιου Γεωργία (Επιμ.), ISBN:9789605864613, Τύπος: Σύγγραμμα, Διαθέτης(Εκδότης): ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΚΡΙΤΙΚΗ ΑΕ
- Σταμ.Κουσίσης 1997, «Εργαστηριακή Βιοχημεία, Αθήνα.
- J.Clark, R.Switzer 1992 Πειραµατική Βιοχηµεία Παν.Εκδ.Κρήτης.
Το μάθημα χωρίζεται σε δύο μέρη (Α) τη δομική βιοχημεία και (Β) τον μεταβολισμό.
Το πρώτο μέρος περιλαμβάνει τη δομή και οργάνωση των βιομορίων με έμφαση τις πρωτείνες. Το δεύτερο μέρος εστιάζει στις κυριότερες μεταβολικές πορείες, τη ρύθμιση και έλεγχό τους καθώς και την αλληλεξάρτηση και συνδυασμό τους.
Το εργαστηριακό μέρος του μαθήματος περιλαμβάνει βασικές εργαστηριακές τεχνικές απομόνωσης, διαχωρισμού και προσδιορισμού βιομορίων που βρίσκουν εφαρμογή και στο χώρο των τροφίμων.
Αναλυτικότερα:
Θεωρητικό Μέρος Μαθήματος
Α ΜΕΡΟΣ: ΔΟΜΙΚΗ ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ
Εισαγωγή, βασικά χαρακτηριστικά των βιομορίων. Αμινοξέα, Πρωτεΐνες (δομές, ιδιότητες), Ένζυμα (κατάταξη, κινητική και παράμετροι που επιδρούν, ρύθμιση, εξήγηση της καταλυτικής τους δράσης, ισοένζυμα). Χρήση ελεύθερων υπολογιστικών εργαλείων για τη μελέτη της τριτοταγούς/τεταρτοταγούς δομής πρωτεινών, ενεργών κέντρων ενζύμων και άλλων δομικών στοιχείων.
Απομόνωση, παραλαβή πρωτεινών και και προσδιορισμός της δομής
Το μάθημα χωρίζεται σε δύο μέρη (Α) τη δομική βιοχημεία και (Β) τον μεταβολισμό.
Το πρώτο μέρος περιλαμβάνει τη δομή και οργάνωση των βιομορίων με έμφαση τις πρωτείνες. Το δεύτερο μέρος εστιάζει στις κυριότερες μεταβολικές πορείες, τη ρύθμιση και έλεγχό τους καθώς και την αλληλεξάρτηση και συνδυασμό τους.
Το εργαστηριακό μέρος του μαθήματος περιλαμβάνει βασικές εργαστηριακές τεχνικές απομόνωσης, διαχωρισμού και προσδιορισμού βιομορίων που βρίσκουν εφαρμογή και στο χώρο των τροφίμων.
Αναλυτικότερα:
Θεωρητικό Μέρος Μαθήματος
Α ΜΕΡΟΣ: ΔΟΜΙΚΗ ΒΙΟΧΗΜΕΙΑ
Εισαγωγή, βασικά χαρακτηριστικά των βιομορίων. Αμινοξέα, Πρωτεΐνες (δομές, ιδιότητες), Ένζυμα (κατάταξη, κινητική και παράμετροι που επιδρούν, ρύθμιση, εξήγηση της καταλυτικής τους δράσης, ισοένζυμα). Χρήση ελεύθερων υπολογιστικών εργαλείων για τη μελέτη της τριτοταγούς/τεταρτοταγούς δομής πρωτεινών, ενεργών κέντρων ενζύμων και άλλων δομικών στοιχείων.
Απομόνωση, παραλαβή πρωτεινών και και προσδιορισμός της δομής
