Παρουσίαση/Προβολή

ΕΙΣΑΓΩΓΗ ΣΤΗ ΒΙΟΠΛΗΡΟΦΟΡΙΚΗ

(806ε) - ΚΩΣΤΟΠΟΥΛΟΣ ΣΠΥΡΟΣ

Περιγραφή Μαθήματος

ΥΛΗ

Εισαγωγή (Κύτταρο, DNA, RNA, πρωτεϊνες, ορολογία)
Βιολογικές Βάσεις Δεδομένων (νουκλεοτιδικών/πρωτεϊνικών ακολουθιών, γονιδιακής έκφρασης, βιβλιογραφίας, …)
Αλγόριθμοι (αναδρομικοί, επαναληπτικοί, backtracking, πολυπλοκότητα, … )
Χάρτες Περιορισμού (αλγόριθμοι εξαντλητικής αναζήτησης, πρόβλημα μερικής πέψης)
Εύρεση Μοτίβων (συναινετική αλληλουχία, brute force αλγόριθμοι)
Γονιδιωματικές Αναδιατάξεις (άπληστοι αλγόριθμοι)
Στοίχιση Αλληλουχιών (αλγόριθμοι δυναμικού προγραμματισμού, alignment, μεγαλύτερη διαδρομή DAG)
Πίνακες αντικατάστασης (PAM, BLOSUM)
Εξελικτικά δέντρα (φυλογένεση με βάση τις αποστάσεις)
ΗΜΜ

ΒΙΒΛΙΟ-ΕΥΔΟΞΟΣ

Βιβλίο [21522]: Εισαγωγή στους Αλγορίθμους Βιοπληροφορικής έκδ. 2010 Συγγραφείς: NEIL C. JONES, PAVEL A. PEVZNER ISBN: 978-960-461-388-5 Διαθέτης (Εκδότης): ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΚΛΕΙΔΑΡΙΘΜΟΣ ΕΠΕ
Βιβλίο [5110]: Βιοπληροφορική έκδ. 2009 Συγγραφείς: Σοφία Κοσσιδά ISBN: 978-960-9309-60-8 Διαθέτης (Εκδότης): ΕΚΔΟΣΕΙΣ ΝΕΩΝ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΩΝ ΙΔΙΩΤΙΚΗ ΚΕΦΑΛΑΙΟΥΧΙΚΗ ΕΤΑΙΡΕΙΑ
ΒιΒλίο [86054818]: Βιοπληροφορική και Λειτουργική Γονιδιωματική έκδ. 2019 Συγγραφείς: Jonathan Pevsner ISBN: 978-618-5135-17-1 Διαθέτης (Εκδότης): ΑΚΑΔΗΜΑΪΚΕΣ ΕΚΔΟΣΕΙΣ Ι. ΜΠΑΣΔΡΑ & ΣΙΑ Ο.Ε

Ημερομηνία δημιουργίας

Σάββατο 16 Μαΐου 2020